Le Centre Suisse de Recherches Scientifiques en Côte d’Ivoire (CSRS) est placé sous la double tutelle des deux ministères chargés de la recherche scientifique en Côte d’Ivoire et en Suisse, co-signataires d’une convention de coopération scientifique entre les deux pays.

• En Suisse, la tutelle est assurée par la « Leading House » désignée par le secrétariat d’Etat à la recherche et à l’éducation (SER), en l’occurrence l’Institut Tropical et de Santé Public (Swiss Tropical and Public Health) à Bâle dont le Directeur est Prof Jürg Utzinger.
• En Côte d’Ivoire, la tutelle est assurée par le Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique (MESRS).